Protein–RNA interactions for Protein: P01669

Ig kappa chain V-III region PC 7769, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01669 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01669 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01669 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01669 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01669 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01669 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01669 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01669 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01669 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01669 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01669 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01669 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01669 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01669 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01669 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01669 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01669 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01669 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01669 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
P01669 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01669 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01669 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01669 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01669 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01669 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01669 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01669 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01669 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01669 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01669 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01669 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01669 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01669 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01669 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01669 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01669 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01669 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01669 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01669 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01669 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01669 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01669 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01669 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01669 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01669 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01669 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01669 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01669 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01669 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01669 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01669 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01669 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01669 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01669 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01669 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P01669 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01669 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P01669 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01669 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01669 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P01669 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01669 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01669 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01669 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01669 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01669 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01669 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01669 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01669 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01669 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01669 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01669 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01669 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01669 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P01669 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01669 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01669 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01669 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01669 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01669 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01669 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01669 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01669 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01669 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01669 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01669 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01669 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01669 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01669 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01669 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01669 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01669 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01669 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01669 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01669 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01669 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01669 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01669 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01669 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01669 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms