Protein–RNA interactions for Protein: P01667

Ig kappa chain V-III region PC 6308, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01667 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01667 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01667 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01667 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01667 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01667 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01667 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01667 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01667 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01667 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01667 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01667 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
P01667 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01667 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01667 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01667 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01667 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01667 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
P01667 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01667 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01667 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01667 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01667 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01667 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01667 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01667 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01667 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01667 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01667 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01667 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01667 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01667 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01667 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01667 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01667 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01667 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01667 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01667 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01667 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01667 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01667 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01667 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01667 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01667 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01667 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
P01667 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01667 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01667 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01667 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01667 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01667 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01667 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01667 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P01667 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01667 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01667 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01667 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01667 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01667 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01667 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01667 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01667 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01667 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01667 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01667 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
P01667 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
P01667 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01667 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01667 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01667 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01667 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
P01667 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01667 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01667 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01667 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01667 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01667 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01667 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01667 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01667 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01667 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01667 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01667 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01667 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01667 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01667 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.02■□□□□ -0
P01667 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
P01667 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01667 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01667 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01667 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01667 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01667 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01667 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01667 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
P01667 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
P01667 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01667 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
P01667 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01667 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms