Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01641 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01641 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01641 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01641 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01641 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01641 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01641 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
P01641 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01641 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01641 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01641 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01641 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01641 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01641 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01641 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01641 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01641 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01641 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01641 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01641 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01641 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01641 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01641 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01641 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01641 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01641 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01641 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01641 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01641 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01641 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01641 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01641 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01641 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01641 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01641 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01641 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01641 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01641 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01641 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01641 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01641 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01641 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01641 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01641 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01641 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01641 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01641 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01641 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01641 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01641 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01641 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01641 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01641 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P01641 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01641 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01641 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01641 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01641 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01641 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01641 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01641 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01641 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01641 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01641 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01641 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01641 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01641 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01641 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01641 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01641 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01641 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01641 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01641 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01641 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01641 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01641 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01641 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01641 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01641 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01641 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01641 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01641 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01641 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01641 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01641 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01641 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01641 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01641 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01641 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01641 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01641 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01641 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01641 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01641 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01641 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01641 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P01641 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01641 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01641 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 263.5 ms