Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Ccl20O89093 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Ccl20O89093 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Ccl20O89093 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Ccl20O89093 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Ccl20O89093 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
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