Protein–RNA interactions for Protein: O88958

Gnpda1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda1O88958 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms