Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tom1O88746 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tom1O88746 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tom1O88746 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tom1O88746 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tom1O88746 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tom1O88746 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tom1O88746 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tom1O88746 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tom1O88746 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tom1O88746 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tom1O88746 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tom1O88746 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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