Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Capns1O88456 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capns1O88456 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capns1O88456 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capns1O88456 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capns1O88456 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capns1O88456 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Capns1O88456 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capns1O88456 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Capns1O88456 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Capns1O88456 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Capns1O88456 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capns1O88456 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capns1O88456 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Capns1O88456 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capns1O88456 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capns1O88456 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capns1O88456 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capns1O88456 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capns1O88456 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capns1O88456 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capns1O88456 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Capns1O88456 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capns1O88456 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capns1O88456 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capns1O88456 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capns1O88456 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Capns1O88456 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capns1O88456 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Capns1O88456 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capns1O88456 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capns1O88456 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capns1O88456 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capns1O88456 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capns1O88456 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capns1O88456 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Capns1O88456 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capns1O88456 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capns1O88456 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capns1O88456 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capns1O88456 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capns1O88456 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capns1O88456 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capns1O88456 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capns1O88456 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capns1O88456 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capns1O88456 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capns1O88456 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capns1O88456 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capns1O88456 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capns1O88456 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capns1O88456 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Capns1O88456 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capns1O88456 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capns1O88456 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capns1O88456 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Capns1O88456 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capns1O88456 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capns1O88456 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Capns1O88456 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capns1O88456 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capns1O88456 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capns1O88456 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capns1O88456 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capns1O88456 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capns1O88456 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capns1O88456 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capns1O88456 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capns1O88456 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Capns1O88456 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Capns1O88456 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Capns1O88456 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capns1O88456 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capns1O88456 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Capns1O88456 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capns1O88456 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capns1O88456 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capns1O88456 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capns1O88456 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capns1O88456 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Capns1O88456 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capns1O88456 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capns1O88456 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capns1O88456 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capns1O88456 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capns1O88456 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capns1O88456 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capns1O88456 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capns1O88456 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Capns1O88456 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Capns1O88456 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capns1O88456 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capns1O88456 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capns1O88456 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Capns1O88456 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capns1O88456 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Capns1O88456 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Capns1O88456 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capns1O88456 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Capns1O88456 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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