Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AurkcO88445 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AurkcO88445 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AurkcO88445 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AurkcO88445 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms