Protein–RNA interactions for Protein: O70258

Sgce, Epsilon-sarcoglycan, mousemouse

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgceO70258 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgceO70258 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgceO70258 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgceO70258 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgceO70258 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgceO70258 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgceO70258 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgceO70258 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgceO70258 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgceO70258 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgceO70258 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgceO70258 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgceO70258 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgceO70258 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgceO70258 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgceO70258 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgceO70258 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgceO70258 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgceO70258 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgceO70258 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgceO70258 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgceO70258 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgceO70258 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgceO70258 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgceO70258 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgceO70258 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgceO70258 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgceO70258 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SgceO70258 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgceO70258 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgceO70258 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgceO70258 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgceO70258 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgceO70258 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgceO70258 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SgceO70258 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgceO70258 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgceO70258 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgceO70258 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgceO70258 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgceO70258 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgceO70258 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgceO70258 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgceO70258 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgceO70258 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgceO70258 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgceO70258 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgceO70258 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgceO70258 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgceO70258 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgceO70258 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgceO70258 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgceO70258 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgceO70258 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgceO70258 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgceO70258 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgceO70258 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgceO70258 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgceO70258 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgceO70258 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SgceO70258 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgceO70258 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgceO70258 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SgceO70258 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SgceO70258 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgceO70258 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgceO70258 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgceO70258 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgceO70258 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgceO70258 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgceO70258 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgceO70258 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgceO70258 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SgceO70258 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgceO70258 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgceO70258 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgceO70258 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgceO70258 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgceO70258 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgceO70258 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgceO70258 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgceO70258 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgceO70258 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SgceO70258 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SgceO70258 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SgceO70258 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SgceO70258 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SgceO70258 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SgceO70258 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SgceO70258 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SgceO70258 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SgceO70258 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SgceO70258 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SgceO70258 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SgceO70258 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgceO70258 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgceO70258 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgceO70258 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgceO70258 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgceO70258 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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