Protein–RNA interactions for Protein: O54891

Lgals6, Galectin-6, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgals6O54891 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lgals6O54891 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms