Protein–RNA interactions for Protein: O54851

Gjd2, Gap junction delta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd2O54851 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjd2O54851 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjd2O54851 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjd2O54851 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjd2O54851 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjd2O54851 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjd2O54851 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjd2O54851 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjd2O54851 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjd2O54851 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjd2O54851 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjd2O54851 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjd2O54851 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjd2O54851 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms