Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EdaO54693 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EdaO54693 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EdaO54693 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EdaO54693 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EdaO54693 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EdaO54693 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EdaO54693 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EdaO54693 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EdaO54693 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EdaO54693 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EdaO54693 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EdaO54693 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EdaO54693 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EdaO54693 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EdaO54693 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EdaO54693 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EdaO54693 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EdaO54693 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EdaO54693 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EdaO54693 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EdaO54693 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EdaO54693 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EdaO54693 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EdaO54693 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EdaO54693 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EdaO54693 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EdaO54693 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EdaO54693 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EdaO54693 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EdaO54693 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EdaO54693 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EdaO54693 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EdaO54693 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EdaO54693 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EdaO54693 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EdaO54693 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EdaO54693 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EdaO54693 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EdaO54693 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EdaO54693 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EdaO54693 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EdaO54693 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EdaO54693 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EdaO54693 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EdaO54693 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EdaO54693 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EdaO54693 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EdaO54693 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EdaO54693 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EdaO54693 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EdaO54693 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EdaO54693 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EdaO54693 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EdaO54693 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EdaO54693 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EdaO54693 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EdaO54693 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EdaO54693 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EdaO54693 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EdaO54693 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EdaO54693 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EdaO54693 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EdaO54693 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EdaO54693 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EdaO54693 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EdaO54693 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EdaO54693 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EdaO54693 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EdaO54693 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EdaO54693 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EdaO54693 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EdaO54693 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EdaO54693 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EdaO54693 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EdaO54693 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EdaO54693 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EdaO54693 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EdaO54693 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EdaO54693 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EdaO54693 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EdaO54693 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EdaO54693 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EdaO54693 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EdaO54693 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EdaO54693 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EdaO54693 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EdaO54693 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EdaO54693 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EdaO54693 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EdaO54693 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EdaO54693 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EdaO54693 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EdaO54693 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EdaO54693 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EdaO54693 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EdaO54693 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EdaO54693 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EdaO54693 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
EdaO54693 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms