Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Bnc1O35914 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms