Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3cdO35904 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms