Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Ccl25O35903 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ccl25O35903 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ccl25O35903 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ccl25O35903 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ccl25O35903 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Ccl25O35903 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Ccl25O35903 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Ccl25O35903 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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