Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ppfibp2O35711 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms