Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Gm14905-201ENSMUST00000122351 639 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Gm13571-201ENSMUST00000124654 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Gm43731-201ENSMUST00000196150 666 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Gm43489-201ENSMUST00000196810 993 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 AC153932.1-201ENSMUST00000218558 787 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Vmn1r224-201ENSMUST00000170076 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhx8O35652 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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