Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Opn1mwO35599 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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Opn1mwO35599 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Opn1mwO35599 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Opn1mwO35599 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Opn1mwO35599 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Opn1mwO35599 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Opn1mwO35599 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Opn1mwO35599 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Opn1mwO35599 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms