Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccrl2O35457 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccrl2O35457 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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