Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d1bO35324 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d1bO35324 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d1bO35324 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d1bO35324 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d1bO35324 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d1bO35324 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d1bO35324 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d1bO35324 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d1bO35324 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d1bO35324 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d1bO35324 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d1bO35324 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d1bO35324 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d1bO35324 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d1bO35324 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d1bO35324 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d1bO35324 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d1bO35324 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d1bO35324 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d1bO35324 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d1bO35324 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d1bO35324 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d1bO35324 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d1bO35324 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d1bO35324 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d1bO35324 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d1bO35324 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d1bO35324 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d1bO35324 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d1bO35324 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d1bO35324 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d1bO35324 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d1bO35324 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d1bO35324 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sh2d1bO35324 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sh2d1bO35324 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sh2d1bO35324 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Sh2d1bO35324 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Sh2d1bO35324 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Sh2d1bO35324 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh2d1bO35324 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms