Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms