Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms