Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema3aO08665 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms