Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20939L7N243 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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