Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms