Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms