Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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