Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP9

Fam240a, Family with sequence similarity 240 member A, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam240aJ3QNP9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam240aJ3QNP9 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam240aJ3QNP9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam240aJ3QNP9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam240aJ3QNP9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam240aJ3QNP9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam240aJ3QNP9 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam240aJ3QNP9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam240aJ3QNP9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam240aJ3QNP9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam240aJ3QNP9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam240aJ3QNP9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam240aJ3QNP9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam240aJ3QNP9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam240aJ3QNP9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Fam240aJ3QNP9 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Fam240aJ3QNP9 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Fam240aJ3QNP9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam240aJ3QNP9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms