Protein–RNA interactions for Protein: G3UY57

Trim15, Tripartite motif protein 15, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim15G3UY57 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim15G3UY57 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim15G3UY57 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim15G3UY57 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim15G3UY57 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim15G3UY57 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim15G3UY57 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim15G3UY57 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim15G3UY57 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim15G3UY57 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim15G3UY57 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim15G3UY57 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim15G3UY57 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms