Protein–RNA interactions for Protein: F6ZZG8

Gm5624, Predicted gene 5624 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5624F6ZZG8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm5624F6ZZG8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm5624F6ZZG8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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