Protein–RNA interactions for Protein: F6XK35

Gm21876, Predicted gene, 21876, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21876F6XK35 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21876F6XK35 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21876F6XK35 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21876F6XK35 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm21876F6XK35 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21876F6XK35 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21876F6XK35 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21876F6XK35 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21876F6XK35 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21876F6XK35 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21876F6XK35 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21876F6XK35 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21876F6XK35 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21876F6XK35 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21876F6XK35 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21876F6XK35 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm21876F6XK35 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21876F6XK35 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21876F6XK35 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21876F6XK35 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21876F6XK35 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21876F6XK35 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21876F6XK35 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm21876F6XK35 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm21876F6XK35 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm21876F6XK35 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm21876F6XK35 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm21876F6XK35 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm21876F6XK35 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm21876F6XK35 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21876F6XK35 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms