Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

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Length 693 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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TrdnE9Q9K5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
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TrdnE9Q9K5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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TrdnE9Q9K5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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TrdnE9Q9K5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TrdnE9Q9K5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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