Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6D7

1700024B05Rik, RIKEN cDNA 1700024B05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700024B05RikE9Q6D7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700024B05RikE9Q6D7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms