Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r238E9Q373 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms