Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rsph10bE9PYQ0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms