Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gm3298E9PW80 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gm3298E9PW80 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gm3298E9PW80 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gm3298E9PW80 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Gm3298E9PW80 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Gm3298E9PW80 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3298E9PW80 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms