Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms