Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb3D3Z6J4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms