Protein–RNA interactions for Protein: D3YWX3

9230113P08Rik, RIKEN cDNA 9230113P08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9230113P08RikD3YWX3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
9230113P08RikD3YWX3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
9230113P08RikD3YWX3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
9230113P08RikD3YWX3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
9230113P08RikD3YWX3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
9230113P08RikD3YWX3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
9230113P08RikD3YWX3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
9230113P08RikD3YWX3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
9230113P08RikD3YWX3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
9230113P08RikD3YWX3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
9230113P08RikD3YWX3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
9230113P08RikD3YWX3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
9230113P08RikD3YWX3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
9230113P08RikD3YWX3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
9230113P08RikD3YWX3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
9230113P08RikD3YWX3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
9230113P08RikD3YWX3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
9230113P08RikD3YWX3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
9230113P08RikD3YWX3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
9230113P08RikD3YWX3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
9230113P08RikD3YWX3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
9230113P08RikD3YWX3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
9230113P08RikD3YWX3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
9230113P08RikD3YWX3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
9230113P08RikD3YWX3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
9230113P08RikD3YWX3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
9230113P08RikD3YWX3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
9230113P08RikD3YWX3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
9230113P08RikD3YWX3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
9230113P08RikD3YWX3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms