Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4950D3YUM8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms