Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

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Length 1,276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20547B8JJN0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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Gm20547B8JJN0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Gm20547B8JJN0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Gm20547B8JJN0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20547B8JJN0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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