Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms