Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apba1B2RUJ5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms