Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms