Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Ssxb8B1AY40 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Ssxb8B1AY40 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Ssxb8B1AY40 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Ssxb8B1AY40 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Ssxb8B1AY40 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Ssxb8B1AY40 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Ssxb8B1AY40 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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