Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms