Protein–RNA interactions for Protein: B1AWN9

Tnfrsf25, Tumor necrosis factor receptor superfamily, member 25, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf25B1AWN9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnfrsf25B1AWN9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnfrsf25B1AWN9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnfrsf25B1AWN9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnfrsf25B1AWN9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf25B1AWN9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf25B1AWN9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf25B1AWN9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf25B1AWN9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf25B1AWN9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf25B1AWN9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf25B1AWN9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf25B1AWN9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf25B1AWN9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf25B1AWN9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf25B1AWN9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf25B1AWN9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf25B1AWN9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf25B1AWN9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf25B1AWN9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf25B1AWN9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf25B1AWN9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf25B1AWN9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf25B1AWN9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf25B1AWN9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf25B1AWN9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf25B1AWN9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf25B1AWN9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf25B1AWN9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf25B1AWN9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf25B1AWN9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms