Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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