Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms