Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gbp4A4UUI3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp4A4UUI3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp4A4UUI3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp4A4UUI3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp4A4UUI3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp4A4UUI3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp4A4UUI3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp4A4UUI3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp4A4UUI3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp4A4UUI3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp4A4UUI3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp4A4UUI3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp4A4UUI3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp4A4UUI3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms